京企开发出蛋白质结构“神算子”

   2022-07-25 520

总部位于北京的AI制药企业华深智药日前宣布,在AI和生命科学结合领域实现一项重要突破:在蛋白质结构预测方面开发出全新技术OmegaFold,是全球范围内首个仅从单条蛋白序列就能预测出蛋白质3D结构的算法。

在OmegaFold之前,由谷歌旗下公司DeepMind发布的最佳方法是AlphaFold2和RoseTTAFold两大AI算法,它们主要是从一个蛋白质的进化历史中提取氨基酸的共进化(同源)信息,并根据这种共进化信息预测蛋白质的三维结构。

但是,很多蛋白质缺乏这种同源信息。华深智药创始人彭健博士在社交平台分享了这一突破性进展:“我们的团队一直坚信蛋白质的三维结构可以仅仅从它的序列信息当中预测,本着科学研究的第一性原理,终于开发出了仅从单条蛋白序列就能预测出3D结构的算法OmegaFold。”

研发人员介绍,OmegaFold的出现让人类从此不依赖一个蛋白质必须在进化当中留有印记,就可以获知他的三维结构信息并进一步推断其生物功能。这将大大拓宽人类设计蛋白质的搜索空间和效率。

华深智药是由清华大学人工智能产业研究院孵化,使用AI重构药物开发流程来提高新药研发速度和效率的企业。

 
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